筹备期间，为了一比一真实还原这场海战中的各式战船，剧组主创调取、查阅及实地走访调查近百万字的历史资料，最终实现了这场海战过程中所涉及的5种不同制式共计50艘舰船的复刻建造，其中长达近40米的主战舰船就复刻了12艘之多。与此相较，上海中国海洋博物馆中，唯一一艘复刻的古战船长度仅为31米，而《澎湖海战》所复刻的古战船，是迄今国内复刻体积最大，也是精细度最高及数量最多的。杀青后，谈及这些一比一还原的古战船最终去向，片方负责人称，“这些复刻的古战船，大部分在‘战火中’被撞毁炸坏，还有几艘被一些博物馆和景区收藏起来了。”